תפקידה העיקרי של מערכת איסוף אבק בלחץ שלילי הוא להסיר אבק וחלקיקים מהאוויר, להגן על הסביבה ולמנוע נזק לציוד.
1. סינון: המסננים במערכת יכולים ללכוד חלקיקים קטנים כמו ננומטר. מסננים אלה עשויים בדרך כלל מחומרים בדרגת HEPA-.
2. לחץ שלילי: המערכת יוצרת סביבת לחץ שלילי מתחת ללחץ הסביבה, שואבת אוויר למערכת ומפנה אותו אל המסננים לצורך סינון. לחץ שלילי זה מונע למעשה את זרימת האוויר, ובכך מפחית את פליטת החלקיקים בתוך המערכת.
3. איסוף ואחסון: האוויר המסונן נשפך בחוץ, בעוד חלקיקים שלא נלכדו נאספים ומאוחסנים בקולטים בתוך המערכת לניקוי תקופתי.
4. בקרה אוטומטית: מערכות איסוף אבק בלחץ שלילי מצוידות בדרך כלל במערכת בקרה אוטומטית שיכולה לנקות את המסננים מעת לעת ולהתריע בפני המשתמש על ניקוי ותחזוקה בעת הצורך.